A Comunidade São João Paulo II foi fundada no dia dezesseis de fevereiro de 2017 na cidade de Miracema do Tocantins, sede da diocese. Com o objetivo de ser uma comunidade missionária, as Irmãs colaboram na formação de agentes de pastorais, encontros diocesanos formativos, caritas diocesana em prol das famílias mais vulneráveis, por meio de projetos de hortas comunitárias, doação de alimentos e ações para geração de renda. Além dos trabalhos formativos, também ajuda na missão e dinamização de encontros e orações nas famílias, celebração da palavra nas comunidades e capelas, bem como na animação da liturgia e música litúrgica. Presta serviços na Cúria Diocesana com trabalhos de preparação de encontros para leigos como escola catequética, encontros missionários, formação litúrgica e preparação de materiais formativos tanto religioso, quanto social.